今回のブログもOpenBabelの分子力場の話題です。母核構造など、化合物分子の一部を固定してのコンホメーションサーチをやってみようと思います。 はじめに 前のブログではOpenBabelの分子力場のAPIを利用して低分…
Category: OpenBabel, プログラミング関連オーファンターゲットに対する予測計算：Applicability Indexを計算してみました
2021年8月に発表させていただいたCGBVS法の論文では、応用として学習データのないターゲットの予測可能性について検証しています。この論文ではデータのない標的タンパクに対する化合物スクリーニングの予測精度（AUROC）…
Category: CGBVS/CzeekS, DRAGON/alvaDesc, Machine LearningSimple tips when performing curation of chemogenomics data
If you are someone who is intending to create predictive models to determine, for example, the probability of …
Category: Machine Learning