先日、環状ペプチドを低分子化するための”Peptide-to-Small Molecule”という手法が、国内の研究グループより発表されました。 Yoshida S, Uehara S, Kondo N, et al. …
PDBファイルの残基番号を修正する 後編
はじめに 前編ではFASTAファイルを読み込む部分のプログラムを作成しました。後編ではOpenBabelを利用してPDBファイルの残基番号の修正をします。プログラムに入力するデータなどは前編で紹介したものを利用する仕様に…
PDBファイルの残基番号を修正する 前編
はじめに RCSB Protein Data Bank (RCSB PDB) には非常に多くのタンパク質の構造が登録されていますが、稀に残基番号がずれている場合があります。そのようなPDBファイルの場合、これに紐付いてい…
【プレスリリース】岡山大学とAI創薬による新薬開発の共同研究を開始しました
インテージヘルスケアと岡山大学の共同研究の開始についてプレスリリースをいたしました。研究テーマは、悪性腫瘍をはじめとする難治性疾患治療薬開発プロジェクトになります。詳細は以下をご覧ください。 インテージヘルスケア、岡山大…
エクセル形式の化合物リストを作成する
はじめに このブログを始めた頃はPythonはあまり得意ではなく、専らC++でプログラムを書いてました。しかしながら、Pythonを使用せざるを得ないことが多く、私も大分Pythonに慣れてきました。私の最初のブログを見…