商売道具 私は普段仕事に使う道具には拘るようにしています。例えばキーボードにはかなり拘っています。キーボードはプログラマーにとっては大切な商売道具です。前のブログにも書きましたが、きっかけは左の小指を痛めたことです。キ…
プログラミングが捗る親指Ctrl
LinuxではCtrlキーを多用する 私は普段の仕事ではLinuxを使用しています。勿論Windowsも使用しますがTera Termなどの端末エミュレータばかり使うので、結局Linuxを使用しているのと本質的には変わ…
LigandScoutでdual inhibitorのスクリーニング
今回は、LigandScoutを使ったdual inhibitorのスクリーニングに関する以下の文献を紹介したいと思います。また、実際に文献の一部をトレースしたいと思います。ただしLigandScoutのバージョンの違い…
in silico 創薬のためのC/C++プログラミング環境
ブログ開始 こんにちは、私はインテージヘルスケアの金井といいます。in silico創薬における受託解析計算などを仕事にしています。今回、私もブログなるものを書くことになりました。何分初めてのことで、in silico…
Ligand Expoに対するファーマコフォア探索
今回は、PARP-1のファーマコフォアを使って、Ligand Expoに登録されている化合物データに対して探索を行ってみます。 Step 1: Ligand Expoから化合物データの取得 ここから以下の２つのファイルを…