GNINAを用いたドッキングシミュレーション Posted on 2025年5月19日2025年6月19日 by kaneko 理論創薬研究所の金子信人です。今回はオープンソースのドッキングシミュレーションソフトウェアを用いて、低分子化合物と標的タンパク質のドッキングを行っていきます。 参考論文GNINA 1.0: molecular docki… Category: AI創薬関連, Docking Read more
ドッキングプログラムsminaのビルド Posted on 2023年3月7日2023年3月7日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 はじめに 最近CMakeに関する話題についてブログ投稿していて、OpenBabelやRDKitを利用したプログラムをビルドするためのCMakeの利用方法について紹介してきました。今回は実践編ということで、私が良く利用する… Category: Docking, Linux関連, プログラミング関連 Read more
OpenBabelでC++プログラミング ～部分構造検索 その3～ Posted on 2020年12月6日2022年6月29日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 前回から大分時間が経ってしまいましたが、今回も部分構造検索の応用の話題です。ドッキング計算結果のSDファイルから必要な条件を満たすドッキングポーズを選出するプログラムを紹介します。 Category: Docking, OpenBabel, プログラミング関連 Read more