大学等のアカデミアとの共同研究プログラムを開始しました。インテージヘルスケアが化合物探索・化合物デザインに加え、化合物提供までを行う共同研究プログラムです。詳細は以下をご覧ください。 インテージヘルスケア、AI創薬アカデ…
OpenBabelを利用するC++プログラムのCMakeによるビルド
はじめに 前回はCMakeの簡単な使い方を紹介しました。今回はOpenBabelを利用したC++プログラムのビルド(コンパイル)について紹介します。一旦CMakeLists.txtファイル作成してしまえば、その後のプログ…
CMakeを利用したC++プログラムのコンパイル
はじめに 実際のC++のプログラムはソースコードのファイルが単一である場合はほとんど無いです。少なくともプログラム本体とヘッダーファイルは分離して扱います。また、OpenBabelやRDKit等のライブラリも複数リンクす…
DeepCubistによる環状ペプチドの低分子化
前回、Deep Quartetを用いて環状ペプチドの低分子化を行いました。 本稿では、籠型骨格を生成するDeepCubist(文献1)を用いて環状ペプチドの低分子化を行ってみたいと思います。 文献1:Umedera K,…
Deep Quartetによる環状ペプチドの低分子化 (2)
前回、論文のファーマコフォアを参考に環状ペプチドの低分子化をDeep Quartet (DQ)を用いて行いました。 化合物A(図1)は、DQより生成された化学構造の1つですが、環状ペプチドから得られたファーマコフォアをほ…