In Silico 創薬

Deep Quartetによる環状ペプチドの低分子化 (2)

前回、論文のファーマコフォアを参考に環状ペプチドの低分子化をDeep Quartet (DQ)を用いて行いました。化合物Ａ(図1)は、DQより生成された化学構造の１つですが、環状ペプチドから得られたファーマコフォアをほ…

Category: Deep Quartet

先日、環状ペプチドを低分子化するための”Peptide-to-Small Molecule”という手法が、国内の研究グループより発表されました。 Yoshida S, Uehara S, Kondo N, et al. …

はじめに前編ではFASTAファイルを読み込む部分のプログラムを作成しました。後編ではOpenBabelを利用してPDBファイルの残基番号の修正をします。プログラムに入力するデータなどは前編で紹介したものを利用する仕様に…

はじめに RCSB Protein Data Bank (RCSB PDB) には非常に多くのタンパク質の構造が登録されていますが、稀に残基番号がずれている場合があります。そのようなPDBファイルの場合、これに紐付いてい…

インテージヘルスケアと岡山大学の共同研究の開始についてプレスリリースをいたしました。研究テーマは、悪性腫瘍をはじめとする難治性疾患治療薬開発プロジェクトになります。詳細は以下をご覧ください。インテージヘルスケア、岡山大…