Direct MaxFlux法による遷移状態予測 Posted on 2025年7月10日2025年7月10日 by kaneko 理論創薬研究所の金子信人です。今回は化学反応の遷移状態を予測するオープンソースソフトウェアを紹介します。 参考文献Locating Transition States by Variational Reaction Pa… Category: AI創薬関連 Read more
GESimによる分子類似性評価 Posted on 2025年6月19日2025年7月10日 by kaneko 理論創薬研究所の金子信人です。今回は分子類似性評価ソフトウェアのGESimの紹介をしていきます。 参考文献GESim: ultrafast graph-based molecular similarity calcula… Category: AI創薬関連 Read more
AiZynthFinderによる逆合成解析 Posted on 2025年6月5日2025年6月19日 by kaneko 理論創薬研究所の金子信人です。今回はオープンソースの逆合成解析ソフトウェアのAiZynthFinderを紹介します。逆合成解析とはある化合物を合成するときに、どんな反応を用いてどんな原料を使えばいいのかという考え方で、有… Category: AI創薬関連 Read more
GNINAを用いたドッキングシミュレーション Posted on 2025年5月19日2025年6月19日 by kaneko 理論創薬研究所の金子信人です。今回はオープンソースのドッキングシミュレーションソフトウェアを用いて、低分子化合物と標的タンパク質のドッキングを行っていきます。 参考論文GNINA 1.0: molecular docki… Category: AI創薬関連, Docking Read more
BR-SAScoreによる分子の合成難易度予測 Posted on 2025年4月24日2025年6月5日 by kaneko はじめまして、理論創薬研究所の金子信人と申します。今回より、ケモインフォマティクス初学者へ向けた論文の紹介とコードの実装を実演していきます。有機合成や分子生物学を研究しているけどコンピューターによる解析に挑戦してみたいと… Category: AI創薬関連 Read more