理論創薬研究所の金子信人です。今回はヘテロ環構造のバイオアイソスター(生物学的等価体)を探索するソフトウェアを紹介します。 参考論文The Heterocycle Isostere Explorer: A Computa…
投稿者: kaneko
SMARTS-RXによる反応性解析のための官能基マッピング
理論創薬研究所の金子信人です。今回はSMILESをもとに分子の反応性を予測するための官能基情報をマッピングするSMARTS-RXを紹介します。 参考論文SMARTS-RX: a SMARTS-based represen…
MoleculeResolverによる物質名からのSMILES検索
理論創薬研究所の金子信人です。今回は物質名から化合物情報を取得するMoleculeResolverを紹介します。 参考論文How to crack a SMILES: automatic crosschecked che…
Chempropを活用した機械学習による化学特性予測
理論創薬研究所の金子信人です。今回は化学特性予測のための機械学習パッケージのオープンソースソフトウェアを紹介します。 参考文献Chemprop: A Machine Learning Package for Chemic…
Direct MaxFlux法による遷移状態予測
理論創薬研究所の金子信人です。今回は化学反応の遷移状態を予測するオープンソースソフトウェアを紹介します。 参考文献Locating Transition States by Variational Reaction Pa…