創薬計算用MCPサーバーの作成 Posted on 2025年8月22日2025年8月22日 by 理論創薬研究所 吉森 篤史 理論創薬研究所の吉森です。今回はRDKitを使って簡単な創薬計算用MCPサーバーをWindowsで構築したいと思います。 MCPサーバーの作成 Powershellを管理者権限で起動する。 rdkit_mcpフォルダにt… Category: AI創薬関連 Read more
gpt-ossとPubChem MCP Serverの連携 Posted on 2025年8月20日2025年8月22日 by 理論創薬研究所 吉森 篤史 理論創薬研究所の吉森です。今回は、gpt-ossからPubChem MCP Serverを使えるように設定したいと思います。 LM Studioとgpt-ossのインストール LM StudioをWindows 11にイ… Category: AI創薬関連 Read more
Direct MaxFlux法による遷移状態予測 Posted on 2025年7月10日2025年9月11日 by kaneko 理論創薬研究所の金子信人です。今回は化学反応の遷移状態を予測するオープンソースソフトウェアを紹介します。 参考文献Locating Transition States by Variational Reaction Pa… Category: AI創薬関連 Read more
GESimによる分子類似性評価 Posted on 2025年6月19日2025年7月10日 by kaneko 理論創薬研究所の金子信人です。今回は分子類似性評価ソフトウェアのGESimの紹介をしていきます。 参考文献GESim: ultrafast graph-based molecular similarity calcula… Category: AI創薬関連 Read more
AiZynthFinderによる逆合成解析 Posted on 2025年6月5日2025年6月19日 by kaneko 理論創薬研究所の金子信人です。今回はオープンソースの逆合成解析ソフトウェアのAiZynthFinderを紹介します。逆合成解析とはある化合物を合成するときに、どんな反応を用いてどんな原料を使えばいいのかという考え方で、有… Category: AI創薬関連 Read more