母核構造を固定してコンホメーションサーチ Posted on 2021年11月14日2022年2月22日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 今回のブログもOpenBabelの分子力場の話題です。母核構造など、化合物分子の一部を固定してのコンホメーションサーチをやってみようと思います。 はじめに 前のブログではOpenBabelの分子力場のAPIを利用して低分… Category: OpenBabel, プログラミング関連 Read more
OpenBabelでコンホメーションサーチ Posted on 2021年9月2日2022年2月22日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 前回に引き続き分子力場の話題の第二弾です。今回は最安定構造を探索してみようと思います。 Category: Linux関連, OpenBabel, プログラミング関連 Read more
OpenBabelで分子構造のエネルギー極小化 Posted on 2021年8月29日2022年2月22日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 論文書いていたため、なかなかブログの更新していなかったのですが、久々にOpenBabelプログラミングネタのブログを投稿していこうと思います。今回はOpenBabelの分子力場を利用した計算をテーマにしたいと思います。 Category: Linux関連, OpenBabel, プログラミング関連 Read more
OpenBabelやRDKitのAPIドキュメント Posted on 2021年4月13日2022年2月22日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 今回はOpenBabelやRDKitなどのフリーツールを利用してプログラミングする際に必須であるAPIドキュメントについてです。 Category: Linux関連, OpenBabel, RDKit, プログラミング関連 Read more
RDKitでもC++プログラミング ～類似構造検索～ Posted on 2021年4月1日2022年2月22日 by 株式会社インテージヘルスケア 金井 千里 今回の話題は前回から引き続き類似構造検索（Similarity Search）についてです。タイトル通り、RDKitでC++プログラミングするという内容です。RDKitを取り上げるのは初めてで、ブログって何を書くか毎回… Category: Linux関連, RDKit, プログラミング関連 Read more