はじめに キシダ化学さんが提供しているバーチャルライブラリの一部の化合物についてCGBVS法によるプロファイリングをやってみました。このバーチャルライブラリーはキシダ化学さんが扱っているビルディングブロックを組み合わせて…
Category: AI創薬関連, CGBVS/CzeekSカテゴリー: CGBVS/CzeekS
CGBVS予測モデルの更新（ChEMBL30）とラインナップの増加
CGBVSによる化合物スクリーニングソフトウェア「CzeekS」のマシンラーニングベース予測モデルが更新されました。主な更新内容は以下となります。 ChEMBLデータのリリース30を使用しました Kinaseモデル対象タ…
Category: CGBVS/CzeekSChEMBL29のデータを利用したCGBVSの予測精度の検証
今回は弊社のソフトウェア製品であるCzeekSを使って、CGBVS法の予測精度の検証を行いました。現在弊社で作成済みのCGBVSモデルはChEMBL27のデータを基にしております。ChEMBLdbの最新バージョンは29な…
Category: CGBVS/CzeekS, Machine LearningApplication of different machine learning approaches to ligand prediction of orphan GPCR targets
As I have mentioned in my previous blog, in this blog I will be talking about LightGBM. However, this is not e…
Category: CGBVS/CzeekS, DRAGON/alvaDesc, Machine Learningオーファンターゲットに対する予測計算：Applicability Indexを計算してみました
2021年8月に発表させていただいたCGBVS法の論文では、応用として学習データのないターゲットの予測可能性について検証しています。この論文ではデータのない標的タンパクに対する化合物スクリーニングの予測精度（AUROC）…
Category: CGBVS/CzeekS, DRAGON/alvaDesc, Machine Learning