今回のブログもOpenBabelの分子力場の話題です。母核構造など、化合物分子の一部を固定してのコンホメーションサーチをやってみようと思います。 はじめに 前のブログではOpenBabelの分子力場のAPIを利用して低分…
カテゴリー: プログラミング関連
OpenBabelでコンホメーションサーチ
前回に引き続き分子力場の話題の第二弾です。今回は最安定構造を探索してみようと思います。
OpenBabelで分子構造のエネルギー極小化
論文書いていたため、なかなかブログの更新していなかったのですが、久々にOpenBabelプログラミングネタのブログを投稿していこうと思います。今回はOpenBabelの分子力場を利用した計算をテーマにしたいと思います。
OpenBabelやRDKitのAPIドキュメント
今回はOpenBabelやRDKitなどのフリーツールを利用してプログラミングする際に必須であるAPIドキュメントについてです。
RDKitでもC++プログラミング ～類似構造検索～
今回の話題は前回から引き続き類似構造検索（Similarity Search）についてです。タイトル通り、RDKitでC++プログラミングするという内容です。RDKitを取り上げるのは初めてで、ブログって何を書くか毎回…