理論創薬研究所の吉森です。今回はRDKitを使って簡単な創薬計算用MCPサーバーをWindowsで構築したいと思います。 MCPサーバーの作成 Powershellを管理者権限で起動する。 rdkit_mcpフォルダにt…
Category: AI創薬関連投稿者: 理論創薬研究所 吉森 篤史
gpt-ossとPubChem MCP Serverの連携
DeepCubistによる環状ペプチドの低分子化
Deep Quartetによる環状ペプチドの低分子化 (2)
前回、論文のファーマコフォアを参考に環状ペプチドの低分子化をDeep Quartet (DQ)を用いて行いました。 化合物Ａ(図1)は、DQより生成された化学構造の１つですが、環状ペプチドから得られたファーマコフォアをほ…
Category: Deep QuartetDeep Quartetによる環状ペプチドの低分子化
先日、環状ペプチドを低分子化するための”Peptide-to-Small Molecule”という手法が、国内の研究グループより発表されました。 Yoshida S, Uehara S, Kondo N, et al. …
Category: AI創薬関連, Deep Quartet