月: 2021年12月

中編で紹介した分子の重ね合わせの計算方法を実際にC++プログラムを組んでみます。OpenBabelの機能や応用と言うよりかは線型代数の計算がメインなので、C++で行列を扱う方法についても言及したいと思います。

前編から引き続いて分子の回転についてです。今回は分子を重ね合わせるための数式を導出したいと思います。 目的関数 四元数のイントロが終わってようやく本題に入ります。分子の3次元的な重ね合わせですが、動かす分子の座標ベクトル…

今回の話題は分子の回転についてプログラミングしてみます。話が長くなりそうなので、ブログを幾つかに分割して紹介します。 はじめに 前回は母核構造を固定してコンホメーションサーチをしてみました。色々なコンホメーションを発生さ…